Sistine Şapeli, Michelangelo'nun nefes kesici fresklerini sergileyen Vatikan'ın en ikonik yerlerinden biridir. Tavan ve "Son Yargı" özellikle sanat tarihi için çok önemlidir ve her yıl sayısız ziyaretçi çekmektedir.
Bu müze, Yunan ve Roma heykellerinden oluşan koleksiyonuyla saygı görmektedir. Müze, en önemli klasik heykeller arasında sayılan "Laocoön ve Oğulları" ile "Apollo Belvedere "yi içermektedir.
Gregoryen Mısır Müzesi, önemli bir Mısır eserleri koleksiyonuna ev sahipliği yapmaktadır. Hem küçük heykelciklerin hem de büyük lahitlerin yer aldığı bu müze, antik uygarlığa ilgi duyanlar için vazgeçilmez bir ziyaret noktasıdır.
Dört resepsiyon odasından oluşan Raphael Odaları, Raphael tarafından boyanmış freskleriyle ünlüdür. Bu odalar papalık dairelerinin bir parçası olarak hizmet vermiştir ve Yüksek Rönesans sanatının bir kanıtıdır.
Bir zamanlar Papa Alexander VI'nın özel konutu olan Borgia Apartmanı, günümüzde erken Rönesans eserlerinin sergilendiği bir müzedir. Bu eserler arasında Pinturicchio'nun dönemin kültürel ve dini temalarını yansıtan bir dizi freski de yer almaktadır.
Etrüsk uygarlığına ait eserler Gregoryen Etrüsk Müzesi'nin odak noktasıdır. Müze, bronzlar ve ünlü "Todi Mars'ı" da dahil olmak üzere geniş bir koleksiyona sahiptir.
Chiaramonti Müzesi adını Papa Pius VII Chiaramonti'den almıştır. Klasik dünyanın Vatikan sanatı üzerindeki etkisini özetleyen Roma büstleri ve heykelleriyle kaplı uzun bir galeri içerir.
Pinacoteca Vaticana'da ziyaretçiler farklı dönemlere ait çeşitli dini tabloları görebilirler. Caravaggio ve Leonardo Da Vinci gibi Rönesans ustalarının eserleri koleksiyonun bir bölümünü oluşturmaktadır.
Vatikan Müzeleri, Michelangelo ve Raphael'in önemli katkıları da dahil olmak üzere Rönesans'tan Modern döneme uzanan usta sanatçıların eserlerinden oluşan eşsiz bir koleksiyona ev sahipliği yapmaktadır. Bernini'nin cesur heykelleri ve Perugino'nun ruhani freskleri müzelerin koleksiyonunu daha da zenginleştirerek bu duvarlar arasında bulunan sanatsal ifadenin genişliğini göstermektedir.
Michelangelo: Michelangelo, "Adem'in Yaratılışı "nın ikonik tavan fresklerinin merkezi bir parçasını oluşturduğu Sistine Şapeli'ndeki çalışmalarıyla ünlüdür. Etkisi, insan formunu olağanüstü bir gerçekçilikle tasvir etme yeteneğini sergileyen çarpıcı bir mermer heykel olan "Pietà "ya kadar uzanır.
Raphael: Raphael, Raphael Odaları'ndaki Yüksek Rönesans ruhunu özetleyen "Atina Okulu" freskiyle Vatikan'ın cazibesine büyük katkıda bulunur. Önemli eserler arasında "Başkalaşım", "Oddi Sunağı" ve "Müjde" de yer almaktadır.
Leonardo da Vinci: "Aziz Jerome Vahşi Doğada" adlı eseri Vatikan Müzeleri'nde bulunan önemli bir sanat eseridir.
Caravaggio: Sanatçının son eserlerinden biri olan "Deposition" karmaşık duyguları aktarır ve Rönesans'ın en büyük tablolarından biri olarak kabul edilir.
Vatikan Müzeleri ayrıca Carlo Carrà, Giorgio de Chirico, Vincent van Gogh, Paul Gauguin, Marc Chagall, Paul Klee, Salvador Dalí ve Pablo Picasso gibi modern sanatçıların eserlerini de içermektedir.
